وهى الإفرازات السامة للفطريات على الأغذية عند توفر الظروف المناسبة لذلك , و الناتجة عن نمو الفطريات سواء على المواد الغذائية الخام أو المعدة للتغذية المباشرة و التوابل.
يُعد قسم السموم وإضافات الأغذية ركيزة أساسية في ضمان سلامة الغذاء في مصر. يواجه القسم العديد من التحديات المتعلقة بمجموعة واسعة من السموم الفطرية، وجودة الأغذية، وإضافات الأغذية المختلفة في المنتجات الغذائية المصرية.
يعتبر QCAP أول معمل مصري معتمد من دول الاتحاد الأوروبي لتحليل الأفلاتوكسين في جميع صادرات الفول السوداني المصري إلى دول الاتحاد الأوروبي. كما أنها تصدر تصاريح لتصدير الشحنات بما يتوافق مع مواصفات المعايير الدولية.
يدعم قسم السموم الفطرية سلامة الأغذية من خلال إدخال وتطوير واعتماد عدد كبير من الأساليب التحليلية الجديدة باستخدام أحدث الأدوات التحليلية، المماثلة لتلك المستخدمة من قبل المختبرات المرجعية للاتحاد الأوروبي للامتثال لأحدث التشريعات الدولية والمحلية.
كشريك في حل تحديات السموم الفطرية في مصر، يقدم المعمل أفضل خدمات الاختبار لجميع السموم الفطرية الخاضعة للرقابة من خلال عدة طرق تحليلية بما في ذلك: